En materia de prevención, el Programa de Derechos Humanos de USAID se propone fortalecer la capacidad de las instituciones del Gobierno y del Estado para diagnosticar anticipadamente los factores y circunstancias que configuran situaciones que amenazan con causar un daño irremediable a los derechos de personas y comunidades, y adoptar medidas preventivas dirigidas a contrarrestar tales factores y disminuir la vulnerabilidad de las personas y comunidades.

En desarrollo de este propósito, el Programa continúa brindando asistencia técnica y financiera a varios proyectos estatales y gubernamentales con los cuales se relacionó durante la primera fase (2001-2006), introduciendo los cambios que han sido recomendados en procesos de evaluación interna o externa, de conformidad con las instituciones concernidas. De igual manera, el Programa ofrece cooperación a nuevos proyectos y programas de las entidades estatales y gubernamentales, incluidas las entidades territoriales.

Los principales proyectos que reciben el apoyo del Programa de Derechos Humanos de USAID, dentro del componente de prevención, son: